即便钛换热器的功能再强大，也需要定期清理维护才可以，否则它的性能也会受到污物的影响而降低。众所周知，钛换热器长时间使用的话其表面容易产生污垢，这将大大影响钛换热器的转换效率，而这就是钛换热器定期清洗维护的必要性。
清洗钛换热器的时候，可以采用不解体清洗的方式，而是用水以与介质流动反方向冲洗将杂物冲出，但要求水的压力不得高于工作压力。也可用对不锈钢无腐蚀性的化学清洗剂清洗，将设备拆解之后用棕刷洗刷板片表面污垢，但要不得用金属刷洗刷，以免损伤板片影响防腐能力。
由于任何部件都会有老化的时候，所以要通过维护延长其使用寿命，对于钛换热器来说，维护重点就是它的螺栓、密封垫等易损件。